103/01/24-營利事業如因員工違反內部規定予以扣薪，應列報其他收入科目或薪資費用科目減項
營利事業於發放薪資時，因員工未達業績或違反人事規定予以扣薪，營利事業在帳務處理部分，應將該筆扣款列報其他收入科目或作為薪資費用科目的減項，倘經稽徵機關查獲未依規定列帳申報，將以漏報收入或虛增成本費用予以補稅並處罰鍰。
營利事業為達內部控制之目的，如員工之出勤紀錄不良、經常請假、未達業績及未遵守內部行事規則等，常會以扣薪作為懲罰手段。營利事業每月結算員工應發薪資時，均先扣減勞、健保費、請假及其他未達業績等扣款後，以匯款或付現方式支付予員工，於每年1月底前將上一年度扣繳員工之稅款數額，開具扣繳憑單，彙報稽徵機關，並於辦理年度營利事業所得稅結算申報時，按應發薪資支出扣繳申報資料調整後列報薪資費用科目，屬營利事業負擔之勞、健保費用，則列報保險費用科目，至於員工因遲到、請假或業績未達目標而遭到扣款部分，營利事業並未支出該筆款項，應將該筆扣款列報其他收入科目或薪資費用科目的減項，才不致發生短漏報課稅所得額。
【舉例說明】
國稅局查核某大型人壽保險公司100年度營利事業所得稅結算申報薪資費用科目，發現該公司對其員工設有業績目標，未達目標者會按比例予以扣薪，經查100年度對員工扣薪金額為300萬元，惟未將該扣薪金額列報為其他收入科目或作為薪資費用之減項，經該局查獲依所得稅法第110條規定予以補稅50餘萬元並處以1倍之罰鍰，合計本稅加罰鍰金額超過百萬元。
呼籲營利事業應儘速檢查自己的帳務，若有前述情形，請儘速作帳務更正，於未經他人檢舉及稽徵機關調查前自動補報並補繳所漏稅款，可免處漏稅罰。
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